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1.杀菌程度。灭菌程度是一次性口罩灭菌与不灭菌的区别之一。虽然两者都是在无菌车间生产，但无菌口罩的灭菌程度和标准会远大于非无菌口罩，生产无菌口罩的车间的无菌水平也会高于非无菌口罩。

2.微生物指标。一次性和非无菌口罩都属于一次性医用口罩，都是按照YY/T 0969生产的。们的微生物指标是不同的。无菌口罩要求无菌，非无菌口罩只要求有限的微生物。

3.防护效果不同。非无菌口罩是普通的防尘口罩，一般不能有效帮助隔离细菌和病毒。们只适合一般雾霾天，防尘防风。无菌口罩消毒后可杀灭或去除病原微生物，使无害化；由于滤料呼吸阻力低，吸附能力强，能有效隔离污染源。

4.医用口罩由口罩面和张力带组成，中口罩面分为内、中、外三层。常见的医用口罩是四层、八层、十六层的普通纱布口罩。

工厂车间广泛使用非无菌口罩。通常情况下雾天或刮风天气时可以佩戴防护，无菌口罩则多用于医院。